Я без понятия в каком состоянии твоя проводка. Штатно реле стоит. Более правильно подключать именно через реле. Но включать зажигания ради того, чтоб поднять или опустить стекло это ппц как неудобно. Поэтому решай сам.
На многих иномарках, кстати, стеклоподъемники работают тоже только после включения зажигания. Хочешь закрыть окно? Включаешь зажигание, с ним запускается топливный насос, приборка, ЭБУ, ДХО и остальное. Через несколько секунд (именно столько надо чтоб закрыть-открыть окно) зажигание выключаешь и все обесточивается. Лажа еще та.