Боковые ниши в багажнике в воде - если фонари загерметизированы хорошо, меняй уплотнитель ляды (багажника, а не стекла).
Щели, особенно в местах скруглений на уплотнителе, можно увидеть - выняв крышку, залазишь в багажник с закрытой лядой. Вот через это дело вода и залетает. По крайней мере пока не поменял уплотнитель (вроде бы и не дубовый) заливало и бока и в нишу запаски тоже оттуда подтекало, при сильном длительном ливне.